Geo Conflict 3 の攻略
「戦闘中に撤退すると落ちる」場合のプレイの仕方を書いてきましたが、
この不具合に該当する環境であっても設定でBGMをOFFにしておけば撤退しても落ちないということがわかりました。

http://mixi.jp/view_bbs.pl?comm_id=223645&id=1761353
https://www36.atwiki.jp/discstation/pages/13.html#id_36d2271f

なので、BGMをOFFにすればLv上げもできますし、
戦闘不能者が出るまで戦うこともできますし、
黒騎士もラスボスも無理に一度きりの戦いだと思わず普通にプレイすることができます。
お騒がせしてしまいすみませんでした。